单倍体重育种中的应用主要有以下几个方面：（） 研究物种进化规律 植物性状遗传分析 构建植物基因组
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克服杂种分离，缩短育种年限，节省人力、物力。将杂种F1或F2的花药离体培养得到单倍体植株，经过染色体加倍，可得到纯合基因型个体，从而缩短育种年限。;利用单倍体进行突变体的选择及利用。单倍体的基因没有显隐性关系，可有效地发现、选择它所产生的突变体。由花药、花粉培养得到的单倍体植株可用组织培养技术快繁和保存材料，便于诱导和选择突变体。