UCSC基因组浏览器可以直接输入物理位置查询基因信息。
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UCSC基因组浏览器支持生成适于文献出版和打印的高质量图像。打印前用户可以在序列碱基栏左端标签处点击鼠标右键选择配置管理按钮，打开设置页面，可在标题栏中添加通道输出图片标题，还可以选择增加组合名称和染色体位置方式将标题加入到通道中。鼠标左键拖拽各通道对应的灰色工具条还可以根据输出需要改变各通道的位置。用户完成通道图像配置后，点击导航栏中view按钮下拉菜单中的PDF/PS选项，选择所需的文件输出格式保存图像。